Negi Springfield là một pháp sư 10 tuổi người Xứ Wales, vốn từ nhỏ đã mơ ước trở thành một Magister Magi (tạm dịch: "Pháp sư Bậc thầy"), tức là trở thành một pháp sư siêu phàm đi khắp thế gian, chuyên dùng phép thuật để "cứu nhân độ thế". Tất nhiên những Magister Magi này phải sử dụng một vỏ bọc khéo léo để che giấu thân phận thật sự của mình, ví dụ như là một thành viên của một tổ chức phi chính phủ.

Đồng thời, việc Negi luôn mong ước trở thành một Magister Magi bắt nguồn từ khát khao được gặp người cha của mình, Nagi Springfield, một pháp sư huyền thoại có sức mạnh vô địch với biệt hiệu "Thousand Master". Mọi người cho rằng Nagi Springfield đã qua đời ngay từ lúc Negi chưa sinh ra, nhưng Negi vẫn tin là cha mình còn sống vì lúc nhỏ cậu đã từng gặp cha một lần, và sau này một pháp sư đã cung cấp bằng chứng rằng Nagi vẫn còn sống.

Sau khi tốt nghiệp Học viện Pháp thuật Merdiana ở xứ Wales, Negi nhận một nhiệm vụ đặc biệt: cậu phải rời bỏ thế giới phép thuật để đi công cán ở thế giới thực với mục đích rèn luyện các kỹ năng trước khi cậu có thể trở thành một Magister Magi thật sự. Cụ thể hơn, Negi phải trở thành thầy giáo dạy tiếng Anh của một lớp học toàn nữ tại Học viện Mahora ở Nhật Bản. Tất nhiên, việc tiếp quản một lớp học gồm 31 nữ sinh, với mỗi nữ sinh có một tính cách và một vấn đề khác nhau là điều không hề dễ dàng đối với cậu thầy giáo trẻ con mới 10 tuổi. Câu chuyện cứ thế tiếp diễn với việc Negi dần dần nhận được sự kính nể của các nữ sinh trong lớp 3A, với việc cậu tận tình giải quyết những vấn đề vướng mắc trong cuộc sống và trong học tập của các học trò, và tất nhiên, với việc cậu phải đối phó với những vấn đề có liên quan đến phép thuật - xuất phát từ bên ngoài cũng như từ nội bộ trường Mahora, mà nhiều vấn đề đó có thể đe dọa đến sự an nguy của Negi cũng như của trường Mahora. Trong loạt manga, có thể nhận thấy nhân vật Kagurazaka Asuna, học trò lớp 3-A và cũng là người ở chung phòng trọ với Negi, là người bạn thân thiết nhất của cậu, luôn sát cánh cùng Negi trong những lúc khó khăn (mặc dù hai người này có một khởi đầu không mấy dễ chịu).

Ban đầu Mahō Sensei Negima! có diễn tiến khiến cho người đọc nghĩ rằng loạt series mới này sẽ giống như các manga bishōjo khác của tác giả như Love Hina. Tuy nhiên sau đó Mahō Sensei Negima! đã nhanh chóng mang một sắc thái riêng biệt với bậc tiền bối của mình: nó có sự hòa trộn giữa các thể loại bishōjo, thể loại hành động của shōnen, thể loại giả tưởng, kinh dị, lãng mạn và hài hước. Bản thân tác giả Akamatsu nhấn mạnh rằng ông đặc biệt mong muốn tạo ra một thứ gì đó "khác" so với Love Hina. Nhân vật chính Negi là một cậu bé 10 tuổi ngây thơ, chưa hiểu rõ tình yêu thật sự, và những mẩu chuyện giữa Negi với Kagurazaka Asuna và những nữ sinh khác trong lớp của mình thật ra là những "phiên bản thu nhỏ" của những "tình tiết lãng mạn kỳ quái" thường thấy trong các manga bishōjo, nhanh chóng khuếch tán và được xây dựng với mục đích hài hước. Hơn nữa, tình cảm giữa nhiều nữ sinh trong trường/lớp thường đối với Negi giống như là tình cảm của một người chị đối với một đứa em nhỏ nhắn dễ thương hơn là tình cảm yêu đương trai gái.

Vì vậy, nhân vật Negi là một sự tương phản với Keitaro trong Love Hina cũng như với những nhân vật chính thường thấy trong các bishōjo manga. Negi là một nhân vật có tính cách chăm chỉ, tận tâm, có năng lực làm việc rất cao và có tính tình khiến nhiều người khác dễ mến, tuy nhiên vì ngoại hình "con nít" cũng như tuổi đời còn quá nhỏ của mình (thầy giáo mà nhỏ tuổi hơn phần lớn các học trò của mình), Negi rất ư là ngây thơ, vô tư, trong sáng, và đôi khi cậu cảm thấy khó có thể thực hiện công việc giảng dạy một cách "nghiêm túc" như các thầy giáo bình thường, hơn thế nữa nhiều khi các học trò của cậu không xem cậu là thầy giáo mà xem cậu như một đứa em trai nhỏ, một đứa bạn để chơi đùa, và thậm chí là một... đồ chơi dễ thương.